合肥職業技術學院有醫學院、汽車工程學院、機電工程學院、軌道交通學院、生物工程學院、信息工程與傳媒學院、經貿旅游學院、建筑工程學院、基礎教育學院、馬克思主義學院等學院，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

1、院系設置
醫學院

汽車工程學院

機電工程學院

軌道交通學院

生物工程學院

信息工程與傳媒學院

經貿旅游學院

建筑工程學院

基礎教育學院

電大（繼續教育學院）

馬克思主義學院

2、合肥職業技術學院簡介
合肥職業技術學院是合肥市屬綜合性高職院校，是省教育廳確立的安徽省首批16所地方技能型高水平大學之一，是國家“創新發展行動計劃”優質�？聘叩嚷殬I院校建設單位。
2002年，由原巢湖衛生學校、巢湖農業學校（安徽省土地管理學校）、巢湖財政學校合并升格為巢湖職業技術學院。隨后，安徽省汽車運輸高級技工學校、安徽廣播電視大學巢湖分校和巢湖商業干部學校先后并入。2012年4月，教育部批準巢湖職業技術學院更名為合肥職業技術學院。